IrsiCaixa incorpora la tècnica de 'Next Generation Sequencing' per a la determinació de resistències als antiretrovirals

El Servei de Seqüenciació de l’Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa incorpora, des del desembre del 2017, la tècnica d’ultraseqüenciació - Next Generation Sequencing per a la determinació de les resistències als antiretrovirals. Fins ara, la detecció de les mutacions associades a resistències es feia per seqüenciació poblacional.

Next Generation Sequencing detecta la presència de mutacions de manera individualitzada en les cadenes del material genètic i permet determinar la seva freqüència en la població viral. A més, aquesta tècnica incorpora la determinació de les resistències genotípiques als inhibidors de la integrasa sense cost addicional.

Els nous informes de resultats incorporen informació addicional. D’una banda, resultats sobre les mutacions detectades en almenys el 20% de la població viral, equivalents als resultats que s’obtenen amb la seqüenciació poblacional. I d’altra banda, identifiquen mutacions presents en baixes proporcions (5%) en la població viral, que aporten informació addicional sobre les varietats virals menys freqüents.

El Servei de Seqüenciació

El Servei de Seqüenciació d’IrsiCaixa realitza la determinació de resistències genotípiques als antiretrovirals en transcriptasa reversa, en proteasa i en integrasa, a més del test de tropisme genotípic del VIH. La determinació de les resistències es fa a partir de plasma. En el cas de mostres de pacients amb baixa càrrega viral, hi ha la possibilitat de concentrar la mostra mitjançant ultracentrifugació.

El servei funciona des del 1999, i l’any 2002 el Servei Català de la Salut el va designar centre de referència per al test de resistències als antiretrovirals. En paral·lel a aquesta tasca assistencial, també participa en projectes de recerca i assajos clínics, en col·laboració amb altres institucions i companyies farmacèutiques.